Генетичне профілювання бактерій роду Pseudomonas, що уражують бобові культури

  • Л. А. Данкевич
DOI: https://doi.org/10.7124/FEEO.v22.935

Анотація

Мета. З метою коректної внутрішньовидової ідентифікації та оцінки групової гетерогенності було проведено фінгепринтування геномів ізольованих нами і колекційних штамів «Pseudomonas lupinі», а також типових представників роду Pseudomonas, що уражують бобові культури. Методи. В ході досліджень було використано мікробіологічні, молекулярно-генетичні (REP-ПЛР) методи та методи молекулярної філогенетики (UPGMA). Результати. Оцінена генетична гетерогенність ізольованих нами і колекційних штамів «Pseudomonas lupinі» штамів. Встановлено спорідненість ізольованих нами і колекційних штамів «Pseudomonas lupinі» з типовими представниками виду Pseudomonas syringae, патогенними для бобових культур за BOX, REP та ERIC профілями. Висновки. BOX, ERIC і REP-профілювання геному збудника бурої бактеріальної плямистості люпину виявило значну його генетичну гетерогенність (від 20 до 50 %) та спорідненість із представниками виду Pseudomonas syringae.
Ключові слова: ідентифікація, генетична гетерогенність, REP-ПЛР, збудник бурої бактеріальної плямистості люпину.

Посилання

Patyka V.P. Phytopathogenic Bacteria in Contemporary Agriculture. Microbiologichny zhurnal. 2016. Vol. 78(6). P. 71–83.

Patyka W., Gnatiuk T., Zhytkevych N., Kalinichenko A. Occurrence of the pathogenic bacteria Pantoea agglomerans in soybean cultivation. Progress in Plant Protection. 2015. Vol. 55(3). P. 280−285.

Zhy`tkevy`ch N.V., Novoxacz`ky`j L.M., Dankevy`ch L.A., Gnatyuk T.T. Curtobacterium flacumfaciens − novy`j zbudny`k zaxvoryuvannya soyi v Ukrayini. XII z’yizd Tovary`stva mikrobiologiv Ukrayiny` im. S.M. Vy`nogracz`kogo: tezy` dopovidej (Uzhgorod, 25–30 trav. 2009 r.). Uzhgorod: Uzhgorods`ky`j nacional`ny`j universy`tet, 2009. P. 303.

Dankevy`ch L.A. Fenoty`pni ta genoty`pni vlasty`vosti zbudny`ka buroyi bakterial`noyi plyamy`stosti lyupy`nu. My`kroby`ol. zhurn. 2006. Vol. 68(6). P. 20–27.

Bel`tyukova K.Y`, Koroleva Y`.B., Muras V.A. Baktery`al`nye bolezny` zerno – bobovy`x kul`tur. K.: Naukova dumka, 1974. 39 p.

Gvozdyak R.I., Pasichny`k L.A., Yakovleva L.M., Moroz S.M., Ly`tvy`nchuk O.O., Zhy`tkevy`ch N.V., Xodos S.F., Bucenko L.M., Dankevy`ch L.A., Gry`nny`k I.V., Paty`ka V.P. Fitopatogenni bakteriyi. Bakterial`ni xvoroby` rosly`n. K.: TOV "NVP "Interservis", 2011. 444 p.

Brenner D.J, Krieg N.R., Staley J.T., Garrity G.M. Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology. New York USA: Springer Science+ Business Media, 2005. 689 p.

Louws F.J., Rademaker J.L.W., de Bruijn F.J. The three DS of PCR−based genomic analysis of phytobacteria: Diversity, Detection, and Disease Diagnosis. Annual Reviews Phytopathology. 1999. Vol. 37. P. 81−125.

Louws F.J., Fulbright D.W., Stephens C.T. Specific genomic fingerprints of phytopathogenic Xanthomonas and Pseudomonas pathovars and strains generated with repetitive sequences and PCR. Applied and Enviromental Microbiology. 1994. Vol. 60(7). P. 2286−2295.