Розшифрування послідовностей гена субодиниці 1 цитохромоксидазы с (COI) і гена субодиниці α фактора элонгации (EF1Α) ряду видів попелиць фауни Білорусi

  • М. М. Воробьёва
  • Н. В. Воронова
DOI: https://doi.org/10.7124/FEEO.v25.1150

Анотація

Мета. Ген субодиниці 1 цитохромоксидази с (COI) і ген субодиниці α фактора елонгації (EF1α) застосовують для коректної видової діагностики cскладно диференційованих форм попелиць, вивчення генетичної структури виду, оцінки внутрішньовидового і міжвидового генетичного поліморфізму, а також для побудови філогенетичних систем. Методи. Зразки попелиць зібрано на території Білорусі. Послідовності генів COI і EF1α секвеновано з використанням праймерів LCO і EF3. Результати. Отримано нуклеотидні послідовності генів COI і EF1α вісімнадцяти видів попелиць рецентної фауни Білорусі, зокрема, гена COI шести видів попелиць (Aphis fabae mordvilkoi Börn. & Janisch,, Aphis pomi Deg., Aphis spiraecola Patch, Colopha compressa Koch, Panaphis juglandis (Gz.) и Uroleucon hypochoeridis (F.)) та гена EF1α п’ятнадцяти видів попелиць (Anoecia corni (Fabr.), Aphis euphorbiae Kalt., C. compressa, Drepanosiphum platanoidis (Schr.), Gyphina jacutensis Mordv., Hyalopterus pruni (Geoffr.), Longicaudus trirhodus (Walk.), Monaphis antennata (Kalt.), P. juglandis, Periphyllus aceris (L.), Schizolachmus pineti (F.), Sipha maydis Pass., Therioaphis tenera Aiz., Trichosiphonaphis corticis (Aiz.), U. hypochoeridis). Висновки. Послідовності генів COI і EF1α попелиць фауни Білорусі розшифровані і депонують в GenBank.

Ключові слова: попелиці, COI, EF1α, нуклеотидні послідовності, GenBank, BOLD.

Посилання

Cruickshank R.H. Molecular markers for the phylogenetics of mites and ticks. Systematic & Applied Acarology. 2002. Vol. 7, No. 1. P. 3–14. doi: 157.140.2.10/hosted_sites/acarology/saas/saa/pdf07/003-014.

Varabyova M.M. Morphological and genetic variability of aphid species (Sternorrhyncha: Aphidoidea) from different ecologi-cal and taxonomy groups: avtoref. dys. ... kand. biol. nauk. Мinsk, 2018. 28 p. [in Belarus]

Simon C., Frati F., Beckenbach A., Crespi B., Liu H., Flook P. Evolution, weighting, and phylogenetic utility of mitochondrial gene sequences and a compilation of conserved PCR primers. Ann. Entomol. Soc. Am. 1994. Vol. 87, No. 6. P. 651–701. doi: hydrodictyon.eeb.uconn.edu/projects/cicada/resources/reprints/Simon_ea_1994.

Aravind К., Ravikanth G., Uma Shaanker R., Chandrashekara K., V. Kumar A.R., Ganeshaiah K.N. DNA barcoding : An ex-ercise in futility or utility? Current Science. 2007. Vol. 92, No. 9. P. 1213–1216. doi: jstor.org/stable/24097883.

GenBank Overview. USA. 2017. URL: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/ (lаst accessed: 23.02.2019).

BOLD Systems v4. Ontario. 2017. URL: http:/www.barcodinglife.org/index.php/TaxBrowser_Home (lаst accessed: 23.02.2019).

Cho S., Mitchell A., Regier J.C., Mitter C., Poole R.W., Friedlander T.P., Zhao S. A highly conserved nuclear gene for low-level phylogenetics : Elongaton factor-1a recovers morphology based tree for heliothine moths. Mol. Biol. Evol. 1995. Vol. 12, No. 4. P. 650–656. doi: https://doi.org/10.1093/oxfordjournals.molbev.a040244.