Генетична структура райдужної форелі (O. mykiss) чернівецького локального стада за SSR-маркерами

  • О. Ю. Бєлікова
  • О. В. Залоїло
  • С. І. Тарасюк
  • А. І. Мрук
  • В. М. Романенко
DOI: https://doi.org/10.7124/FEEO.v25.1134

Анотація

Мета. В Україні спостерігається тенденція до розвитку високотехнологічних форелевих господарств. Для ведення селекційної роботи необхідним є аналіз генетичної структури райдужної форелі (Oncorhynchus mykiss) за молекулярно-генетичними методами. Метою роботи було дослідження генетичної структури за мікросателітними локусами O. mykiss чернівецького локального стада. Методи. Визначення генетичної структури проводили за показниками: ефективною кількістю алелей на локус (ne), фактичною (Но) та очікуваною (Hе) гетерозиготністю, індексами фіксації (Fis) та поліморфізму (PIC). Результати. Виявлено специфічні особливості структури генофонду локального стада O. mykiss за SSR-локусами OMM 1032, 1077, 1088, STR 15, 60, 73. Середнє значення ne становить 3,87. Зафіксовано високі середні показники Hе та Fis (0,73 та –0,14 відповідно). Для цих ДНК-маркерів характерний високий індекс поліморфізму (0,69). Обґрунтовано можливість проведення аналізу генетичної структури лососевих із використанням SSR-маркерів. Висновки. Виконано аналіз генетичної структури форелі O. mykiss за мікросателітними локусами. Показано, що локальне стадо характеризується високим рівнем гетерозиготності. Проведені дослідження свідчать про ефективність використання обраних локусів для індивідуальної ідентифікації та популяційно-генетичного аналізу.

Ключові слова: Oncorhynchus mykiss, SSR-маркери, гетерозиготність, поліморфізм.

Посилання

Bozhyk V.I., Bachuk Y.O. Сurrent state and prospects of trout farm development іn western Ukraine. Scientific Messenger of Lviv National University of Veterinary Medicine and Biotechnologies named after S.Z. Gzhytskyj. 2014. Vol. 16, No 3 (60), part. 3. P. 26–31. [in Ukrainian]

Mendrishora P., Kurynenko G., Mruk А. Comparative characteristics of age-3–4 rainbow trout females reared in the conditions of the industrial fish farm «Sloboda-Banyliv». Scientific Messenger of Lviv National University of Veterinary Medicine and Biotechnologies named after S.Z. Gzhytskyj. 2017. Vol. 19, No 79. P. 117–121. [in Ukrainian]

Aquaculture of artificial reservoirs. Industrial aquaculture: textbook / ed. A.І. Andriushchenko, N.І. Vovk. Kyiv: NUBiP, 2014. Part. ІІ. 586 p. [in Ukrainian]

O 'Connell M., Wright J. M. Microsatellite DNA in fishes. Reviews in Fish Biology and Fisheries. 1997. Vol. 7 (3). P. 331–363. doi: 10.1023/A:1018443912945.

Tarasjuk S., Bielikova О., Kolisnyk S. Actuality of molecular genetic studies in aquaculture. Problems of Environmental Biotechnology. 2018. No 1. URL: http://ecobio.nau.edu.ua/index.php/ecobiotech/article/view/12877/17714 (Last accessed: 23.02.2019). [in Ukrainian

Moradi A., Keyvanshokooh S. Microsatellite DNA marker in aquatic organisms. Scientific Journal of Biological Sciences. 2013. Vol. 2 (9). P. 184–189. doi: 10.14196/sjbs.v2i9.1001.

Rexroad III C.E., Coleman R.L., Hershberger W.K., Killefer J. Rapid communication: Thirty-eight polymorphic microsatellite markers for mapping in rainbow trout. J. Anim. Sci. 2002. Vol. 80, Is. 2. P. 541–542. doi: 10.2527/2002.802541x.

Glover K.A. Genetic characterisation of farmed rainbow trout in Norway: intra and inter-strain variation reveals potential for iden-tification of escapees. BMC Genetics. 2008. Vol. 9, Is. 87. doi: 10.1186/1471-2156-9-87. URL: http://www.biomedcentral.com/1471-2156/9/87 (Last accessed: 23.02.2019).

Johnson N.A., Rexroad C.E., Hallerman E.M., Vallejo R.L., Palti Y. Development and evaluation of a new microsatellite multi-plex system for parental allocation and management of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) broodstocks. Aquaculture. 2007. Vol. 266. P. 53–62. doi: 10.1016/j.aquaculture.2007.02.054.

Estoup A., Presa P., Krieg F., Vaiman D., Guyomard R. (CT) and (GT) microsatellites: a new class of genetic markers for Salmo trutta L. (brown trout). Heredity. 1993. Vol. 71. P. 488–496.

Presa P., Guyomard R. Conservation of microsatellites in three species of salmonids. Journal of Fish Biology. 1996. Vol. 49 (6). P. 1326–1329. doi: 10.1111/j.1095-8649.1996.tb01800.x.

Zhivotovsky L.A. Population biometrics. Moscow: Nauka, 1991. 271 p. [in Russian]

Kuznetsov V.M. Wright’s F-statistics: estimation and interpretation. Problems of Productive Animal Biology. 2014. Vol. 4. P. 80–104. [in Russian]

Nagy S., Poczai P., Cernбk I., Gorji A.M., Hegedэqs G., Taller J. PICcalc: An Online Program to Calculate Polymorphic Information Content for Molecular Genetic Studies. Biochem Genet. 2012. Vol. 50, № 9–10. Р. 670–672. doi: 10.1007/s10528-012-9509-1.

Takezaki N., Nei M. Genetic distances and reconstruction of phylogenetic trees from microsatellite DNA. Genetics. 1996. Vol. 144. P. 389–399.

Botstein D., White R.L., Skolnick M., Davis R.W. Construction of a genetic linkage map in man using restriction fragment length polymorphisms. Am J Hum Genet. 1980. Vol. 32. Р. 314–331.