Ксеротолерантний штам Penicillium chrysogenum МF18_10, ізольований із пошкоджених стін Софіївського собору, Київ
Анотація
Мета. Метою роботи було визначення таксономічного положення штаму гриба MF18_10, ізольованого із пошкоджених стін з середньовічними фресками Софійського собору (Київ, Україна). Методи. Гриб було виділено в чисту культуру на селективному для ксерофільних грибів середовищі (агар Чапека з 70 % сахарози). Для макро- та мікроморфологічної характеристики застосовували світлову та скануючу електронну мікроскопію. Молекулярно-біологічну ідентифікацію проводили з використанням нуклеотидної послідовності фрагменту ITS. Результати. На основі фенотипової характеристики грибного ізоляту MF18_10 було встановлено його приналежність до роду Penicillium. Аналіз ITS виявив, що ізолят належить до виду P. chrysogenum, демонструючи його 100 % ідентичність з іншими 78 штамами P. chrysogenum в базі даних GenBank, включаючи типові штами NR_077145 і AY373902, а також поділяючи характерні відмінності в заміщеннях, делеціях і вставках в межах цієї групи. Висновки. Ізольований ксеротолерантний гриб було ідентифіковано як P. chrysogenum, типовий представник внутрішніх приміщень і пилу, а також поширений в мікобіоті пошкоджених історично-культурних артефактів вид. Відмінності в проаналізованих первинних структурах ITS P. chrysogenum не корелювали з джерелом виділення.
Ключові слова: Penicillium chrysogenum, ксеротолерантні гриби, ITS, скануюча електронна мікроскопія.
Посилання
Chen A., Hubka V., Frisvad J., Visagie C., Houbraken J., Meijer M. et al. Polyphasic taxonomy of Aspergillus section Asper-gillus (formerly Eurotium), and its occurrence in indoor environments and food. Studies in Mycology. 2017. Vol. 88. P. 37–135. doi: 10.1016/j.simyco.2017.07.001.
Liu Z., Zhang Y., Zhang F., Hu C., Liu G., Pan J. Microbial Community Analyses of the Deteriorated Storeroom Objects in the Tianjin Museum Using Culture-Independent and Culture-Dependent Approaches. Frontiers in Microbiology. 2018. Vol. 9. P. 802. doi: 10.3389/fmicb.2018.00802.
Unković N., Ljaljević Grbić M., Subakov-Simić G., Stupar M., Vukojević J., Jelikić A. et al. Biodeteriogenic and toxigenic agents on 17th century mural paintings and façade of the old church of the Holy Ascension (Veliki Krčimir, Serbia). Indoor and Built Environment. 2015. Vol. 25 (5). P. 826–837. doi: 10.1177/1420326X15587178.
Sklenář F., Jurjević Ž., Zalar P., Frisvad J. Visagie C., Kolařík M. et al. Phylogeny of xerophilic aspergilli (subgenus Aspergil-lus) and taxonomic revision of section Restricti. Studies in Mycology. 2017. Vol. 88. P. 161–236. doi: 10.1016/j.simyco.2017.09.002.
Tanney J., Visagie C., Yilmaz N., Seifert K. Aspergillus subgenus Polypaecilum from the built environment. Studies in Myco-logy. 2017. Vol. 88. P. 237–267. doi: 10.1016/j.simyco.2017.11.001.
Schoch C., Seifert K., Huhndorf S., Robert V., Spouge J., Levesque C. et al. Nuclear ribosomal internal transcribed spacer (ITS) region as a universal DNA barcode marker for Fungi. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2012. Vol. 109 (16). P. 6241–6246. doi: 10.1073/pnas.1117018109.
Houbraken J., Frisvad J., Seifert K., Overy D. Tuthill D., Valdez J. et al. New penicillin-producing Penicillium species and an overview of section Chrysogena. Persoonia – Molecular Phylogeny and Evolution of Fungi. 2012. Vol. 29 (1). P. 78–100. doi: 10.3767/003158512X660571.
Mueller G.M., Bills G.F., Foster M.S. Biodiversity of fungi. Inventory and monitoring methods. Burlington (USA): Elsevier Academic Press, 2006. 777 p.
Koval E.Z., Rudenko A.V., Goncharuk V.V., Voloshchuk N.M. Penicillia in the environment. Kyiv: Naukova Dumka, 2014. Part 1, 436 p., Part 2. 386 p. [in Ukrainian
Polishchuk L.V., Tkachenko K.S. Fomina M.A. Characteristics of ITS-fragment of rDNA of Rhodotorula mucilaginosa isola-ted from gastrointestinal tract of centenarian. Factors in Experimental Evolution of Organisms. 2017. Vol. 21. P. 284–287.
Fomina M.A., Polishchuk L.V., Tkachenko K.S., Hong J.W., Zelena L.B., Ianieva O.D., Pidgorskyi V.S. Complex identifica-tion of red yeast isolate from gastrointestinal tract of Hucul long-liver (Carpathians, Ukraine). Mikrobiolohichnyi zhurnal. 2016. Vol. 78 (5). P. 2–11.
Hong J., Fomina M., Gadd G. F-RISA fungal clones as potential bioindicators of organic and metal contamination in soil. Journal of Applied Microbiology. 2010. Vol. 109 (2). P. 415–430. doi: 10.1111/j.1365-2672.2009.04665.x.
An K. Kiyuna T., Kigawa R., Sano C., Miura S, Sugiyama J. The identity of Penicillium sp. 1, a major contaminant of the stone chambers in the Takamatsuzuka and Kitora Tumuli in Japan, is Penicillium paneum. Antonie van Leeuwenhoek. 2009. Vol. 96 (4). P. 579–592. doi: 10.1007/s10482-009-9373-0.
Coronado-Ruiz C., Avendaño R., Escudero-Leyva E., Conejo-Barboza G., Chaverri P., Chavarría M. Two new cellulolytic fungal species isolated from a 19th-century art collection. Scientific Reports. 2018. Vol. 8 (1). P. 7492. doi: 10.1038/s41598-018-24934-7.