Аналіз клітинної локалізації РН доменa Bcr-Abl з білком USP1 та розробка програми для оцінки їх сайтів фосфорилювання

С. В. Антоненко, Д. С. Гур'янов, І. В. Кравчук, Г. Д. Телегєєв

Анотація


Мета. Ця робота присвячена вивченню клітинної локалізації РН домена Bcr-Abl разом із білком USP1 та створенню зручного програмного інструмента для агрегації даних щодо сайтів фосфорилювання білків. Методи. Трансфекція клітин ссавців. Підбір праймерів для ПЛР. Флуорисцентна мікроскопія у широкому полі та STED мікроскопія. Базові підходи у створенні програм на Python. Результати. Виявлена колокалізація між USP1 та PH доменом білка Bcr-Abl. Підібрані праймери до основних доменів білка USP1. Було створено програмний інструмент phospho-aggregate. Отримано зображення внутрішньоклітинної локалізації PH домена Bcr надвисокої роздільної здатності. Висновки. Ядерна локалізація USP1 в клітинах 293T, а також точкові колокалізації USP1 з РН доменом онкобілка Bcr-Abl вказують на сильну асоціацію досліджуваних білків зі специфічними клітинними структурами. Ідентифікація цих клітинних структур може допомогти виявити біологічні функції USP1 за хронічної мієлоїдної лейкемії (ХМЛ). Програма phospho-aggregate може бути використана для спрощення аналізу та порівняння сайтів фосфорилювання білків. Субдифракційні зображення внутрішньоклітинного розподілу PH домена Bcr показують, що він кластеризується в структурах, які нагадують клатринові везикули.
Ключові слова: Bcr-Abl, USP1, PH домен, кортактин, клітинна локалізація, сайти фосфорилюванння.


Повний текст:

PDF

Посилання

  • Поки немає зовнішніх посилань.