Варіабельність генів CYP4 i CYP6 у попелиці Aphis fabae mordvilkoi Börner & Janisch, 1922

Н. В. Воронова, М. М. Воробьева, Ю. В. Бондаренко

Анотація


Мета. Оцінити варіабельність генів CYP450 4-го і 6-го сімейств, витягнутих їхніх даних про повногеномне секвенування попелиці Aphis fabae mordvilkoi, що розвивається в Білорусі, на бузок (Philadelphus coronaries L.). Методи. Секвенування генома попелиць провели в Центрі секвенування ДНК Університету штату Юта (Солт-Лейк-Сіті, США). Послідовності генів CYP4 і CYP6 були витягнуті з пулу прочиток генома шляхом послідовної фільтрації вирівнювань прочиток по референсним послідовностям генів CYP450 4-го і 6-го сімейства, витягнутих з 3 знаходяться у відкритому доступі геномів попелиць (Acyrthosiphon pisum Harris, 1776, Myzus persicae (Sulžer, 1776) і Diuraphis noxia (MordvilkoexKurdjumov, 1913)). Всі виявлені унікальні варіанти збірки оцінювали як індивідуальний ген. Результати. У геномі A. fabae mordvilkoi виявлений 31 ген CYP4, з яких 24 є варіанти гена CYP4C1. У сімействі CYP6 виявлено 19 генів, 8 з яких є варіанти CYP6A13. Варіабельність нуклеотидних і амінокислотних послідовностей CYP4 і CYP6 у A. fabae mordvilkoi виявилася, рівною мірою, високою. Висновки. У геномі попелиці A. fabae mordvilkoi серед генів CYP450 сімейства CYP4 переважають гени CYP4C1, а гени CYP6 представлені переважно генами CYP6A13. Решта гени зазначених родин представлені в геномі A. fabae mordvilkoi одиничними копіями.
Ключові слова: попелиці, цитохроми р450, Aphis fabae, трофічна спеціалізація, копійність генів.


Повний текст:

PDF (Russian)

Посилання

  • Поки немає зовнішніх посилань.