Аналіз поліморфного варіанта G742A гена BHMT у хворих на псоріаз
Анотація
Мета. Аналіз однонуклеотидного поліморфізму G742A гена бетаін-гомоцистеінметилтрансферази S (BHMT) у хворих на псоріаз у східно-українській популяції. Методы. Генеалогічна інформація була зібрана у 72 пробандів та 60 осіб контрольної групи. Аналіз ДНК проводився за допомогою ПЛР-ПДРФ. Перевірка статистичних гіпотез про асоціацію вивчених генотипів із захворюванням і оцінка рівності рядів розподілу проведена за допомогою критерію χ2 на рівнях значущості 0,05, 0,01 і 0,001. Результати. Результати генотипування показали, що частоти алелів і генотипів в контрольній групі склали: pG = 0,70, qA = 0,30, GG – 45,0 %, GA – 50,0 %, AA – 5,0 %, у хворих на псоріаз – pG = 0,743, qA = 0,257, GG – 50,0 %, GA – 48,6 %, AA – 1,4 %, відповідно. Фактичний розподіл генотипів за поліморфними варіантами G742A гена BHMT статистично значимо відрізняється від теоретично очікуваного при рівновазі в загальній групі хворих. Розподіл частот генотипів при псоріазі в цілому і в контролі показав статистично значущу різницю між ними (р = 0,007). Частота генотипу АА в контрольній групі вище, ніж у групі хворих на псоріаз, що не ускладнений на артропатію ? (5,0 % проти 2,2 %, р = 0,029). У групі хворих з віком початку захворювання до 25 років фактичний розподіл генотипів статистично значимо відрізняється від теоретично очікуваного при рівновазі для поліморфного варіанту G742A (p <0,01). Висновок. Результати дослідження поліморфного варіанта G742A гена BHMT у хворих на псоріаз, у тому числі, більш висока частота гомозигот по аллелю А серед хворих, показали можливість їх подальшого врахування при плануванні профілактичних і лікувальних заходів.
Ключові слова: псоріаз, одноуглеродний метаболізм, фолієва кислота, гомоцистеїн, метіонін, бетаїн-гомоцістеінметілтрансфераза S.Посилання
Doolin M.-T., Barbaux S., McDonnell M. et al. Maternal genetic effects, exerted by genes involved in homocysteine remethylation, influence the risk of spina bifida. Am. J. Hum. Genet. 2002. Vol. 71. P. 1222–1226. doi: 10.1086/344209
Cande V. A., Elsasser D., Wendy L. K. et al. Polymorphisms in methionine synthase reductase and betaine-homocysteine S-methyltransferase genes: risk of placental abruption. Mol Genet Metab. 2007. Vol. 91(1). P. 104–110. doi: 10.1016/j.ymgme.2007.02.004
Singh P.R., Lele S.S. Folate gene polymorphisms MTR A2756G, MTRR A66G, and BHMT G742A and risk for coronary artery disease: a meta-analysis. Genet. Test Mol. Biomarkers. 2012. Vol. 16(6). P. 471–475. doi: 10.1089/gtmb.2011.0237
Gibson T.M., Brennan P., Han S. et al. Comprehensive evaluation of one-carbon metabolism pathway gene variants and renal cell cancer risk. PLoS One. 2011. Vol. 6, Iss. 10. e26165. doi: 10.1371/journal.pone.0026165
Guttormsen A.B., Ueland P.M., Nesthus I. et al. Determinants and vitamin responsiveness of intermediate hyperhomocysteinemia. The Hordaland Homocysteine Study. J. Clin. Invest. 1996. Vol. 98(9). P. 2174–2183. doi: 10.1172/JCI119024
Radu A. P., Farcas M.F., Trifa A.P. et al. Association of betaine-homocysteine S-methyltransferase gene G742A SNP and male-fertility. Revista Romana de Medicina de Laborator. 2012. Vol. 20. P. 57–62.
Hooshmand B., Solomon A., Kareholt I. et al. Serum homocysteine, holotranscobalamin, folate and cognition in the elderly: a longitudinal study. J. Intern. Med. 2011. Vol. 271(2). P. 204–212. doi: 10.1111/j.1365-2796.2011.02484.x
Li F., Feng Q., Lee C. et al. Human betaine-homocysteine methyltransferase (BHMT) and BHMT2: common gene sequence variation and functional characterization. Mol. Genet. Metab. 2008. Vol. 94(3). P. 326–335. doi: 10.1016/j.ymgme.2008.03.013
Armitage P., Berry G. Statistical methods in medical research. 3rd ed. Blackwell Scientific Publications, 1994. 620 p.
Атраментова Л.О., Утєвська О.М. Статистичні методи в біології. Харків, 2007. 288 с.
Xu X., Gammon M.D., Zhang H. et al. Polymorphisms of one-carbon-metabolizing genes and risk of breast cancer in a population-based study. Carcinogenesis. 2007. Vol. 28(7). P. 1504–1509. doi: 10.1093/carcin/bgm061
Biselli J.M., Zampieri B.L., Goloni-Bertollo E.M. et al. Genetic polymorphisms modulate the folate metabolism of Brazilian individuals with Down syndrome. Mol. Biol. Rep. 2012. Vol. 39(10). P. 9277–9284. doi: 10.1007/s11033-012-1629-5
Wernimont S.M., Clark A.G., Stover P.J. et al. Folate network genetic variation, plasma homocysteine, and global genomic methylation content: a genetic association study. BMC Med. Genet. 2011. 12:150. doi: 10.1186/1471-2350-12-150