5S рДНК Dactylus glomerata (Poaceae): молекулярна організація та застосування у систематиці

  • A. R. Volkov Чернівецький національний університет імені Юрія Федьковича Україна, 58012, м. Чернівці, вул. Коцюбинського, 2
  • I. I. Panchuk Чернівецький національний університет імені Юрія Федьковича Україна, 58012, м. Чернівці, вул. Коцюбинського, 2

Анотація

Мета. Використання молекулярних методів протягом останніх десятиліть призвело до суттєвого прояснення еволюції та таксономії Poaceae, проте визначення границь між спорідненими трибами все ще залишається актуальною проблемою. Зокрема, використання варіабельних генів, таких як 5S рДНК, є необхідним для подальшого поглиблення існуючих знань стосовно філогенії Poaceae. Для з’ясування філогенетичного положення субтриби Dactylidinae в межах триби Poeae ми вивчали молекулярну організацію 5S рДНК Dactylis glomerata. Методи. Повторювані одиниці 5S рДНК було ампліфіковано за допомогою ПЛР, клоновано і сиквеновано. Результати. Було показано, що в геномі D. glomerata присутній тільки один варіант повтору 5S рДНК довжиною 258 нп, причому рівень внутрішньогеномної подібності повторів виявився високим: від 96,8 до 98,8%. Ці повтори мають бути функціонально активними, оскільки вони містять всі відомі елементи зовнішнього промотора для РНК-полімерази ІІІ. Порівняння послідовностей 5S рДНК D. glomerata показало, що вони є подібними до послідовностей віддалених видів підтриби Aveninae. Висновки. Отримані дані вказують на можливу гібридизацію між представниками підтриб Dactylidinae та Aveninae.

Ключові слова: Dactylis, 5S рДНК, міжгенний спейсер, молекулярна еволюція і систематика, гібридизація.