Аналіз експресії ізоформ ITSN2 та TKS5 в пухлинах грудної залози людини

  • С. В. Кропивко Інститут молекулярної біології і генетики НАН України, Україна, Київ, 03143, вул. Заболотного, 150
  • Л. О. Циба Інститут молекулярної біології і генетики НАН України, Україна, Київ, 03143, вул. Заболотного, 150
  • О. В. Новохацька Інститут молекулярної біології і генетики НАН України, Україна, Київ, 03143, вул. Заболотного, 150
  • Л. А. Сивак Національний інститут раку, Україна, Київ, 03022, вул. Ломоносова, 33/34
  • Т. Є. Тарасенко Національний інститут раку, Україна, Київ, 03022, вул. Ломоносова, 33/34
  • О. М. Грабовий Національний інститут раку, Україна, Київ, 03022, вул. Ломоносова, 33/34
  • А. В. Риндич Інститут молекулярної біології і генетики НАН України, Україна, Київ, 03143, вул. Заболотного, 150
DOI: https://doi.org/10.7124/visnyk.utgis.16.1.899

Анотація

Мета. Незважаючи на великий прогрес у лікуванні, 15 % випадків раку молочної залози залишаються летальними. Попри багаторічні дослідження та великий досвід у лікуванні цього виду раку, однією з основних проблем в діагностиці та лікуванні є його висока клінічна і генетична гетерогенність, тож виявлення маркерів для персоніфікованого лікування хворих є актуальним питанням і досі. Методи. Збір клінічного матеріалу, виділення РНК та аналіз експресі ізоформ ITSN2 та TKS5 за допомогою кількісного ПЛР в реальному часі, використовуючи флюорисцентно мічені зонди. Результати. Ми виявили що, ITSN2-S достовірно знижує свою експресію в HER2/neu-позитивних пухлинах з поганим прогнозом. Достовірних відмінностей в експресії ITSN2-L та TKS5-L в аналізованих зразках виявлено не було. Висновки. Ці дослідження показали можливість виявлення короткої ізоформи ITSN2 (ITSN2-S) як прогностичного маркера цього захворювання.
Ключові слова: рак молочної залози, ITSN2, TKS5, аналіз експресії.

Посилання

Dai X., Li Y., Bai Z., Tang X. Q. Molecular portraits revealing the heterogeneity of breast tumor subtypes defined using immunohistochemistry markers. Sci Rep. 2015. Vol. 5. P. 14499, doi: 10.1038/srep14499

Tang Y., Wang Y., Kiani M. F., Wang B. Classification, Treatment Strategy, and Associated Drug Resistance in Breast Cancer. Clin Breast Cancer. 2016. Vol. 16(5). P. 335–343. doi: 10.1016/j.clbc.2016.05.012

Pourteimoor V., Mohammadi-Yeganeh S., Paryan M. Breast cancer classification and prognostication through diverse systems along with recent emerging findings in this respect; the dawn of new perspectives in the clinical applications. Tumour Biol. 2016. Vol. 37(11). P. 14479–14499.

Leidy J., Khan A., Kandil D. Basal-like breast cancer: update on clinicopathologic, immunohistochemical, and molecular features. Arch Pathol Lab Med. 2014. Vol. 138(1). P. 37–43. doi: 10.5858/arpa.2012-0439RA

Lam S. W., Jimenez C. R., Boven E. Breast cancer classification by proteomic technologies: Current state of knowledge. Cancer Treat Rev. 2014. Vol. 40(1). P. 129–138.

Eroles P., Bosch A., Pérez-Fidalgo J. A., Lluch A. Molecular biology in breast cancer: Intrinsic subtypes and signaling pathways. Cancer Treat Rev. 2012. Vol. 38(6). P. 698–707. doi: 10.1016/j.ctrv.2011.11.005

Dai X., Xiang L., Li T., Bai Z. Cancer Hallmarks, Biomarkers and Breast Cancer Molecular Subtypes. J Cancer. 2016. Vol. 7(10). P. 1281 –1294. doi: 10.7150/jca.13141

Fusco N., Geyer F. C., De Filippo M. R. Martelotto L. G., Ng C. K., Piscuoglio S., Guerini-Rocco E., Schultheis A. M., Fuhrmann L., Wang L., Jungbluth A. A., Burke K. A., Lim R. S., Vincent-Salomon A., Bamba M., Moritani S., Badve S. S., Ichihara S., Ellis I. O., Reis-Filho J. S., Weigelt B. Genetic events in the progression of adenoid cystic carcinoma of the breast to high-grade triple-negative breast cancer. Mod Pathol. 2016. Vol. 29(11). P. 1292– 1305. doi: 10.1038/modpathol.2016.134

Schmidt M., Thomssen C., Untch M. Intrinsic Subtypes of Primary Breast Cancer — Gene Expression Analysis. Oncol Res Treat. 2016. Vol. 39(3). P. 102–110. doi: 10.1159/000444409

Specht K., Harbeck N., Smida J., Annecke K., Reich U., Naehrig J., Langer R., Mages J., Busch R., Kruse E., Klein-Hitpass L., Schmitt M., Kiechle M. Expression profiling identifies genes that predict recurrence of breast cancer after adjuvant CMF-based chemotherapy. Breast Cancer Res Treat. 2008. Vol. 118. P. 45–56. doi: 10.1007/s10549-008-0207-y

Pucharcos C., Casas C., Nadal M., Estivill X., de la Luna S. The human intersectin genes and their spliced variants are differentially expressed. Biochim. Biophys. Acta. 2001. Vol. 1521(1-3). P. 1–11. doi: 10.1016/S0167-4781(01)00276-7

Adams A., Thorn J. M., Yamabhai M., Kay B. K., O'Bryan J. P. Intersectin, an Adaptor Protein Involved in Clathrin-mediated Endocytosis, Activates Mitogenic Signaling Pathways. J. Biol. Chem. 2000. Vol. 275(35). P. 27414–27420.

McGavin M. K., Badour K., Hardy L. A., Kubiseski T. J., Zhang J., Siminovitch K. A. The intersectin 2 adaptor links Wiskott Aldrich Syndrome protein (WASp)-mediated actin polymerization to T cell antigen receptor endocytosis. J Exp Med. 2001. Vol. 194. P. 1777–1787.

Tsyba L., Nikolaienko O., Dergai O., Dergai M., Novokhatska O., Skrypkina I., Rynditch A. Intersectin multidomain adaptor proteins: Regulation of functional diversity. Gene. 2011. Vol. 473. P. 67–75. doi: 10.1016/j.gene.2010.11.016

Gryaznova T., Kropyvko S., Burdyniuk M., Gubar O., Kryklyva V., Tsyba L., Rynditch A. Intersectin adaptor proteins are associated with actin-regulating protein WIP in invadopodia. Cell. Signal. 2015. Vol. 27(7). P. 1499–1508. doi: 10.1016/j.cellsig.2015.03.006

Staub E., Groene J., Heinze M., Mennerich D., Roepcke S. , Klaman I., Hinzmann B., CastanosVelez E., Pilarsky C., Mann B., Brümmendorf T., Weber B., Buhr H.-J., Rosenthal A. An expression module of WIPF1 -coexpressed genes identifies patients with favorable prognosis in three tumor types. J Mol Med. 2009. Vol. 87. P. 633–644. doi: 10.1007/s00109-009-0467-y

Murphy D. A., Courtneidge S. A. The 'ins' and 'outs' of podosomes and invadopodia: characteristics, formation and function. Nat. Rev. Mol. Cell. Biol. 2011. Vol. 12(7). P. 413–426.

Courtneidge S. A. Cell migration and invasion in human disease: the Tks adaptor proteins. Biochem. Soc. Trans. 2012. Vol. 40(1). P. 129–132. doi: 10.1042/BST20110685

Blouwa B., Sealsb D. F., Passa I. et al. A role for the podosome/invadopodia scaffold protein Tks5 in tumor growth in vivo. European Journal of Cell Biology. 2008. Vol. 87(8–9). P. 555–567. doi: 10.1016/j.ejcb.2008.02.008

C. M. Li, Guoan Chen, T. L. Dayton, C. Kim-Kiselak, S. Hoersch, C. A. Whittaker, R. T. Bronson, D. G. Beer, M. M. Winslow, T. Jacks. Differential Tks5 isoform expression contributes to metastatic invasion of lung adenocarcinoma. Genes and Development. 2013. Vol. 27. P.1557–1567. doi: 10.1101/gad.222745.113

Drury S., Anderson H., Dowsett M. Selection of REFERENCE genes for normalization of qRT-PCR data derived from FFPE breast tumors. Diagn. Mol. Pathol. 2009. Vol. 18(2). P. 103–107. doi: 10.1097/PDM.0b013e31817c1ae2

Lyng M. B., Laenkholm A. V., Pallisgaard N., Ditzel H. J. Identification of genes for normalization of real-time RT-PCR data in breast carcinomas. BMC Cancer. 2008. Vol. 22. P. 20. doi: 10.1186/1471 -2407-8-20

Radonic A., Thulke S., Mackay I. M., Landt O., Siegert W., Nitsche A. Guideline to reference gene selection for quantitative real-time PCR. Biochem Biophys Res Commun. 2004. Vol. 313. P. 856–862. doi: 10.1016/j.bbrc.2003.11.177